Monitoraggio Pandemia Italiana basato sul Tasso di Positivita' (TPR)

Versione prelimionare a breve nuova veste grafica:

I riferimenti sono nelle mie pubblicazioni tra le quali:

Predictive capacity of COVID-19 test positivity rate
Fenga Livio; Gaspari Mauro, SENSORS, 2021, 21, pp. 1 - 15.

The impact of Test Positivity on Surveillance with Asymptomatic Carriers
Mauro Gaspari. Epidemiologic Methods 11.s1 (2023): 20220125.

A Low-Cost Early Warning Method for Infectious Diseases with Asymptomatic Carriers
Mauro Gaspari. Healthcare 2024, 12(4), 469.

Lo studio The impact of Test Positivity on Surveillance with Asymptomatic Carriers presenta il TPR usato in questo sito e mostra come questo precede di circa 5 giorni l'incidenza considerando 60 diverse situazioni.
Il metodo sviluppato con Livio Fenga per le previsioni sugli ospedalizzati se applicato all'ultimo periodo con il nuovo TPR tiene conto dell'impatto dovuto ai vaccini.

Il TPR calcolato in questo sito e' basato sui tamponi e sui nuovi positivi, e' una variazione del TPR definito nell'articolo pubblicato con Livio Fenga.
A partire dal 17/11/2021 introduco una nuova modalita' di calcolo che permette di anticipare ulteriormente l'andamento dell'indicatore rispetto alla rolling average standard, con correzione il 23/11/2021 per migliorarne la stabilita'.
Il TPR cosi definito permette di confrontare l'andamento delle regioni e risulta essere un potente strumento per il monitoraggio. Per calcolare il TPR i dati nazionali sono ottenuti come somma delle regioni. Questo ha permesso di correggere diversi errori, gia' corretti per le regioni, e di aggiungere dove possibile i dati sui tamponi antigenici. Per le regioni Veneto, Toscana, Friuli, Piemonte e Alto Adige sono presenti i dati sui tamponi antigenici utilizzati da ottobre 2020 fino al 15 Gennaio 2021.
Per le altre regioni i dati del TPR nella seconda fase fino al 15 Gennaio 2021 possono essere imprecisi in quanto mancano i dati sui temponi antigenici.

I successivi diagrammi presentano nell'ordine sia al livello nazionale che regionale:

L'andamento del TPR verso Ospedalizzati e Terapie Intensive, viene anche riportata la percentuale dei vaccinati sia quelli che hanno avuto un unica dose, sia quelli che hanno completato il percorso. La percentuale dei vaccini fatti in Gran Bretagna e' molto piu' alta: oltre al 45% hanno completato il percorso e a oltre il 60% e' stata somministrata una sola dose.

Il rapporto tra incidenza e TPR.

Indici di ospedalizzazione (nuova versione). Questo diagramma include la rolling average a 7 giorni: la percentuale tra terapie intensive e ospedalizzati (4 giorni prima); la percentuale tra Ospedalizzati e Positivi (quattro giorni prima), e la percentuale tra morti e terapie intensive (quattro giorni prima). Questi strumenti, definiti anche variant buster, possono individuare cambiamenti di tendenza che possono essere dovuti alla presenza di nuove varianti.

Il confronto tra Incidenza e Tamponi: l'incidenza dovrebbe seguire l'andamento dei tamponi, se si discosta possono esserci problemi nella trasmissione dei dati, si nota chiaro un discostamento in Sicilia nel periodo Gennaio Febbraio 2021.

Calcolo di Rt basato sul TPR, versione preliminare. Questa modalita' di calcolo di Rt puo' catturare anche variazioni dovute a casi non noti. Nel periodo invernale i valori di Rt sono conformi, riguardo l'andamento, a quelli calcolati con il metodo CovidStat dell'INFN, si discostano invece anticipando l'andamento nel periodo estivo. Quando la discesa del tasso di positivita' si attenua Rt comincia a salire.

La nuova versione del TPR permette di anticipare l'analisi dell'andamento di circa 3 giorni rispetto alla vecchia versione ed alla rolling average su 7 giorni standard, inoltra risulta piu' stabile e quindi piu' affidabile nelle previsioni sull'andamento degli ospedalizzati.
Commenti giorni precedenti.
01 Maggio 2024: Dopo un periodo stazionario siamo di fronte ad una ripresa dei contagi la stima attuale del TPR e' 0.891. Rt vicino ad uno, stimato a 1.096.
08 Maggio 2024: Il TPR torna a scendere la stima attuale del TPR e' 0.757. Rt torna sotto l'uno, stimato a 1.096.
15 Maggio 2024: Il TPR riprende la salita e torna sopra 1%, la stima attuale del TPR e' 1,002. Rt torna sopra l'uno, stimato a 1.061.
22 Maggio 2024: La lieve salita del TPR continua, la stima attuale e' 1,043. Rt sopra l'uno, stimato a 1.025.
29 Maggio 2024: La salita del TPR continua, la stima attuale e' 1,385. Rt sopra l'uno, stimato a 1.086.
5 Giugno 2024: La salita del TPR continua, la stima attuale e' 1,87. Rt sopra l'uno, stimato a 1.133. Si osserva una crescita in quasi tutte le regioni, ma rimangono stabili a livello nazionali gli indicatori sugli ospedalizzati.
12 Giugno 2024: La salita del TPR continua, la stima attuale e' 2.094. Rt sopra l'uno, stimato a 1.066. Rimangono stabili a livello nazionali gli indicatori sugli ospedalizzati.
19 Giugno 2024: La salita del TPR continua, la stima attuale e' 2.751. Rt sopra l'uno, stimato a 1.156. Rimangono stabili a livello nazionali gli indicatori sugli ospedalizzati.
26 Giugno 2024: La salita del TPR continua, la stima attuale e' 3.323. Rt sopra l'uno, stimato a 1.118. Rimangono stabili a livello nazionali gli indicatori sugli ospedalizzati.
3 Luglio 2024: La salita del TPR continua, la stima attuale e' 4.793. Rt sopra l'uno, stimato a 1.243. Salita in quasi tutte le regioni, rimangono stabili a livello nazionali gli indicatori sugli ospedalizzati.
10 Luglio 2024: La salita del TPR continua, la stima attuale e' 7.016. Rt sopra l'uno, stimato a 1.294. Rimangono stabili a livello nazionali gli indicatori sugli ospedalizzati.
17 Luglio 2024: La salita del TPR continua, la stima attuale e' 11.09. Rt sopra l'uno, stimato a 1.388. Rimangono stabili a livello nazionali gli indicatori sugli ospedalizzati.
24 Luglio 2024: La salita del TPR continua, la stima attuale e' 13.944. Rt sopra l'uno, stimato a 1.205. Rimangono stabili a livello nazionali gli indicatori sugli ospedalizzati.
22 Agosto 2024: Si evidenzia un picco del TPR il 15 Agosto a 18.834. Segue una discesa fino a 17.906. Rt sotto l'uno, stimato a 0.986. Sembra finita quest'ultima ondata. Rimangono stabili a livello nazionali gli indicatori sugli ospedalizzati.
4 Settembre 2024: Continua la discesa del TPR fino a 14.374. Rt sotto l'uno, stimato a 0.921. Picco degli ospedalizzati il 27 Agosto ora sono in calo. Rimangono stabili a livello nazionali gli indicatori sugli ospedalizzati.
18 Settembre 2024: Continua la discesa del TPR fino a 9.997. Rt sotto l'uno, stimato a 0.929.
2 Ottobre 2024: La discesa del TPR si interrotta intorno a meta' settembre con valori intorno a 10.0. Successivamente e' risalito fino a 14.009. Rt nuovamente sopra l'uno, stimato a 1.093.
31 Ottobre 2024: Il TPR nel mese di Ottobre ha ripreso a scendere, valore stimato a 6.531. Rt stimato a 0.817. Si tratta del valore piu' basso del TPR a fine di Ottobre, dopo l'avvento della variante Omicron alla fine del 2021. Al momento nonostante il periodo autunnale non vi sono segni di una possibile ripresa dei contagi.
27 Novembre 2024: Il TPR nel mese di Novembre s' sceso ulteriormente, valore stimato a 3.615. Rt stimato a 0.966. Andamento simile in tutte le regioni, gli indici degli ospedalizzati si mantengono costanti.
La regione selezionata appare in grassetto: